お客様のメールアドレスドメインが変わった際のPerson情報の変更について

すでに設定されているルールエンジンなどを含めて対応が必要になる可能性がありますが、ご記載いただいたような「識別子の設定を一時的に変える」　方法が良いかと思います。
具体的には以下のような方法でできると思います！

• 個人オブジェクトに、退避用のメールアドレス項目を作成する。(他に識別子があるなら不要)
  • 現在のアドレスをキーに更新するのであれば、一旦対比ようにアドレスをコピーする項目を作成
• 管理>顧客データ>個人ユーザーから、Match Criteriaを退避用の項目もしくは別の一意に特定できる識別子に変更
• ルールエンジンでメールアドレスを更新
• Match Criteriaをメールアドレスに修正

ただし、この方法は既存のルールに影響を与えてしまいますので、なるべくルールが実行されていない、ユーザーが作業しないである時間などで実施するのが良いかと思います！